Thuế hộ kinh doanh nhà thuốc có nhiều thay đổi quan trọng từ ngày 01/01/2026, ảnh hưởng trực tiếp đến cách tính thuế, kê khai và thực hiện nghĩa vụ thuế của các nhà thuốc. Vậy hộ kinh doanh phải nộp những loại thuế nào, cách tính ra sao và cần lưu ý gì để tuân thủ đúng quy định? Cùng MISA eShop tìm hiểu chi tiết trong bài viết dưới đây.
1. Thuế cho hộ kinh doanh nhà thuốc là bao nhiêu?
Hoạt động kinh doanh nhà thuốc được xếp vào nhóm phân phối, cung cấp hàng hóa. Theo Nghị định 117/2025/NĐ-CP – quy định tỷ lệ % thuế GTGT và thuế TNCN theo từng ngành nghề, hộ kinh doanh nhà thuốc sẽ tính thuế trên doanh thu với các mức sau:
- Thuế GTGT: 1% doanh thu.
- Thuế TNCN: 0,5% doanh thu.
Như vậy, tổng tỷ lệ thuế mà hộ kinh doanh nhà thuốc phải nộp là 1,5% trên doanh thu tính thuế.
2. Cách tính thuế hộ kinh doanh nhà thuốc theo Thông tư 152/2025/TT-BTC
Từ ngày 01/01/2026, cách tính thuế hộ kinh doanh nhà thuốc được thực hiện theo quy định tại Thông tư 152/2025/TT-BTC. Tùy theo từng nhóm doanh thu, hộ kinh doanh sẽ áp dụng phương pháp tính thuế khác nhau.
Tính thuế suất hộ kinh doanh nhà thuốc nhóm 1
| Tiêu chí | Nội dung |
|---|---|
| Đối tượng áp dụng | Hộ kinh doanh nhà thuốc có doanh thu không quá 1 tỷ đồng/năm. |
| Thuế GTGT | Không phải nộp. |
| Thuế TNCN | Không phải nộp. |
| Hóa đơn điện tử | Không bắt buộc sử dụng. Tuy nhiên, hộ kinh doanh vẫn cần lưu giữ đầy đủ chứng từ và sổ sách để phục vụ việc đối chiếu khi cơ quan thuế yêu cầu. |
| Ví dụ | Nhà thuốc Minh Phúc có doanh thu năm 2026 là 850 triệu đồng.
• Thuế GTGT: 0 đồng • Thuế TNCN: 0 đồng ⇒ Tổng số thuế phải nộp: 0 đồng. |
Tính thuế hộ kinh doanh nhà thuốc nhóm 2
| Tiêu chí | Nội dung |
|---|---|
| Đối tượng áp dụng | Hộ kinh doanh nhà thuốc có doanh thu trên 1 tỷ đồng đến 3 tỷ đồng/năm. |
| Thuế GTGT | Thuế GTGT = Doanh thu × 1% |
| Thuế TNCN | Hộ kinh doanh được lựa chọn một trong hai phương pháp:
|
| Hóa đơn điện tử | Bắt buộc sử dụng hóa đơn điện tử theo quy định. |
| Ví dụ | Nhà thuốc Minh Tâm có doanh thu năm 2026 là 2 tỷ đồng.
• Thuế GTGT: 2.000.000.000 × 1% = 20.000.000 đồng • Thuế TNCN: 2.000.000.000 × 0,5% = 10.000.000 đồng ⇒ Tổng số thuế phải nộp: 30.000.000 đồng. |
Tính thuế hộ kinh doanh nhà thuốc nhóm 3
| Tiêu chí | Nội dung |
|---|---|
| Đối tượng áp dụng | Hộ kinh doanh nhà thuốc có doanh thu trên 3 tỷ đồng đến 50 tỷ đồng/năm. |
| Thuế GTGT | Thuế GTGT = Doanh thu × 1% |
| Thuế TNCN | Thuế TNCN = (Doanh thu − Chi phí hợp lệ) × 17% |
| Hóa đơn điện tử | Bắt buộc sử dụng hóa đơn điện tử. |
| Ví dụ | Nhà thuốc An Phúc có doanh thu 10 tỷ đồng, chi phí hợp lệ 8 tỷ đồng.
• Thuế GTGT: 10.000.000.000 × 1% = 100.000.000 đồng • Thuế TNCN: (10.000.000.000 − 8.000.000.000) × 17% = 340.000.000 đồng ⇒ Tổng số thuế phải nộp: 440.000.000 đồng. |
Tính thuế hộ kinh doanh nhà thuốc nhóm 4
| Tiêu chí | Nội dung |
|---|---|
| Đối tượng áp dụng | Hộ kinh doanh nhà thuốc có doanh thu trên 50 tỷ đồng/năm. |
| Thuế GTGT | Thuế GTGT = Doanh thu × 1% |
| Thuế TNCN | Thuế TNCN = (Doanh thu − Chi phí hợp lệ) × 20% |
| Hóa đơn điện tử | Bắt buộc sử dụng hóa đơn điện tử. |
| Ví dụ | Nhà thuốc Minh Tâm có doanh thu 60 tỷ đồng, chi phí hợp lệ 45 tỷ đồng.
• Thuế GTGT: 60.000.000.000 × 1% = 600.000.000 đồng • Thuế TNCN: (60.000.000.000 − 45.000.000.000) × 20% = 3.000.000.000 đồng ⇒ Tổng số thuế phải nộp: 3.600.000.000 đồng. |
3. Hướng dẫn HKD nhà thuốc nộp tờ khai thuế Quý 2
Để nộp tờ khai thuế Quý II/2026, hộ kinh doanh nhà thuốc có thể lựa chọn nhiều hình thức kê khai khác nhau. Nếu đang sử dụng phần mềm quản lý bán hàng, việc kê khai sẽ được thực hiện nhanh hơn nhờ dữ liệu được đồng bộ tự động. Dưới đây là hướng dẫn chi tiết theo từng phương thức:
- Kê khai thuế qua Cổng thông tin Thuế điện tử
- Kê khai thuế qua Cổng Dịch vụ công (cập nhật mới tháng 3/2026)
- Kê khai thuế qua ứng dụng eTax Mobile
- Kê khai thuế trực tiếp trên MISA eShop
>> Xem chi tiết cách nộp tờ khai thuế tại đây: Kê khai thuế Hộ kinh doanh
4. Cách đăng ký hóa đơn điện tử cho hộ kinh doanh nhà thuốc
Từ khi áp dụng hóa đơn điện tử, hộ kinh doanh nhà thuốc có thể phát hành hóa đơn nhanh chóng, đồng thời dữ liệu cũng được truyền trực tiếp đến cơ quan thuế. Điều này giúp việc kê khai doanh thu, quản lý chứng từ và thực hiện nghĩa vụ thuế trở nên minh bạch, chính xác hơn.
Bước 1. Đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử
Hộ kinh doanh thực hiện đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử với cơ quan thuế theo quy định. Sau khi được chấp thuận, lựa chọn đơn vị cung cấp giải pháp hóa đơn điện tử phù hợp (như MISA meInvoice) để triển khai sử dụng.
Lưu ý: Chi phí sử dụng phần mềm và số lượng hóa đơn sẽ phụ thuộc vào gói dịch vụ mà hộ kinh doanh lựa chọn.
Bước 2. Kích hoạt và sử dụng hóa đơn điện tử
Sau khi hoàn tất đăng ký, hộ kinh doanh sẽ được cấp tài khoản để đăng nhập hệ thống và thực hiện các thao tác phát hành hóa đơn.
Thông thường, quy trình sử dụng bao gồm:
- Đăng nhập phần mềm hóa đơn điện tử.
- Khởi tạo và phát hành hóa đơn khi phát sinh giao dịch theo quy định.
- Ký số và gửi hóa đơn cho người mua, đồng thời dữ liệu được chuyển đến cơ quan thuế theo quy định.
Gợi ý: Nếu sử dụng MISA eShop và kết nối với MISA meInvoice, hộ kinh doanh có thể lập, ký số và phát hành hóa đơn ngay trên phần mềm bán hàng mà không cần nhập liệu nhiều lần, giúp tiết kiệm thời gian và hạn chế sai sót trong quá trình xuất hóa đơn.
5. Hỏi đáp về thuế hộ kinh doanh nhà thuốc
HKD nhà thuốc cho doanh thu 500 triệu đồng thì có xuất hóa đơn điện tử không?
Hộ kinh doanh nhà thuốc có doanh thu 500 triệu đồng/năm không thuộc diện bắt buộc phải sử dụng hóa đơn điện tử theo phân nhóm doanh thu từ Thông tư 152/2025/TT-BTC mà bạn đang xây dựng.
Tuy nhiên, nếu phát sinh nhu cầu xuất hóa đơn cho khách hàng (ví dụ khách hàng là doanh nghiệp, tổ chức yêu cầu hóa đơn), hộ kinh doanh vẫn có thể đăng ký và sử dụng hóa đơn điện tử theo quy định của pháp luật về hóa đơn.
Hộ kinh doanh nhà thuốc không nộp thuế đúng hạn có bị truy thu không?
Theo Nghị định 159/2025/NĐ-CP, hộ kinh doanh nhà thuốc phải chịu trách nhiệm bằng toàn bộ tài sản của mình đối với các nghĩa vụ tài chính phát sinh trong quá trình hoạt động. Vì vậy, nếu không thực hiện quyết định xử phạt vi phạm về thuế đúng thời hạn, hộ kinh doanh có thể bị áp dụng các biện pháp cưỡng chế theo quy định.
Tùy từng trường hợp, cơ quan có thẩm quyền sẽ áp dụng một hoặc nhiều biện pháp sau:
- Thu hồi tiền từ tài khoản ngân hàng đứng tên hộ kinh doanh để thực hiện nghĩa vụ thuế còn thiếu.
- Trích tiền từ tài khoản cá nhân của chủ hộ hoặc các thành viên cùng đăng ký hộ kinh doanh nếu tài khoản kinh doanh không đủ để thanh toán.
- Khấu trừ vào tiền lương hoặc các khoản thu nhập hợp pháp khác của người có nghĩa vụ nộp thuế khi cần thiết.
- Xử lý tài sản theo quy định thông qua biện pháp kê biên đối với chủ hộ và các thành viên đăng ký kinh doanh nếu các phương án thu hồi trước đó không mang lại kết quả.
Do đó, anh/chị nên thực hiện đầy đủ nghĩa vụ kê khai và nộp thuế hộ kinh doanh nhà thuốc đúng hạn để tránh phát sinh các biện pháp cưỡng chế cũng như những ảnh hưởng đến hoạt động kinh doanh.
Nhà thuốc có bắt buộc hóa đơn đầu vào không?
Về nguyên tắc, khi kinh doanh nhà thuốc, hộ kinh doanh cần lưu giữ đầy đủ hóa đơn, chứng từ hợp pháp để chứng minh nguồn gốc của hàng hóa. Đây là một trong những căn cứ quan trọng giúp cơ quan thuế xác minh doanh thu, chi phí và tính hợp pháp của hoạt động kinh doanh khi thanh tra, kiểm tra.
Nếu nhà thuốc xuất hóa đơn bán hàng nhưng không có hóa đơn đầu vào hoặc chứng từ chứng minh nguồn gốc hàng hóa, nguy cơ bị cơ quan thuế yêu cầu giải trình là rất lớn. Trường hợp không chứng minh được nguồn hàng hợp pháp, hộ kinh doanh có thể đối mặt với các rủi ro về thuế và xử lý vi phạm theo quy định.
Đối với nhà thuốc, các nhóm hàng hóa dưới đây cần có hóa đơn, chứng từ hợp pháp khi nhập hàng:
- Thuốc chữa bệnh.
- Thực phẩm bảo vệ sức khỏe (thực phẩm chức năng).
- Mỹ phẩm.
- Trang thiết bị, vật tư y tế.
Vì vậy, ngay từ khi nhập hàng, nhà thuốc nên yêu cầu nhà cung cấp xuất đầy đủ hóa đơn và lưu trữ chứng từ cẩn thận để thuận tiện cho việc đối chiếu, kê khai thuế cũng như chứng minh nguồn gốc hàng hóa khi cần.
MISA eShop OneApp – Quản lý toàn bộ hoạt động kinh doanh nhà thuốc trên một nền tảng duy nhất
Thay vì phải sử dụng nhiều phần mềm riêng lẻ để bán hàng, xuất hóa đơn, ghi sổ kế toán và kê khai thuế, MISA eShop OneApp giúp hộ kinh doanh thực hiện toàn bộ quy trình trên một phần mềm duy nhất.
Mọi dữ liệu được liên thông tự động từ khi phát sinh giao dịch đến khi hoàn thành nghĩa vụ thuế, giúp hạn chế nhập liệu nhiều lần, giảm sai sót và tiết kiệm đáng kể thời gian quản lý.
Với MISA eShop OneApp, hộ kinh doanh nhà thuốc có thể:
- Bán hàng và quản lý doanh thu ngay trên điện thoại hoặc máy tính.
- Xuất hóa đơn điện tử chỉ với vài thao tác nhờ kết nối trực tiếp với MISA meInvoice.
- Tự động ghi nhận sổ sách kế toán theo đúng quy định tại Thông tư 152/2025/TT-BTC.
- Lập và kê khai tờ khai thuế nhanh chóng từ dữ liệu bán hàng đã được đồng bộ.
- Quản lý xuyên suốt trên một hệ thống, không cần chuyển đổi qua nhiều phần mềm khác nhau.
👉 Đăng ký trải nghiệm miễn phí MISA eShop OneApp ngay hôm nay để quản lý bán hàng, hóa đơn, kế toán và thuế trên một nền tảng duy nhất, đơn giản và chính xác hơn.
